Mapa restrykcyjna

[misia12345]

W pojedyncze miejsce restrykcyjne EcoRI plazmidu o wielkości 2.5 kb wklonowano fragment o wielkości 4.5 kb. W plazmidzie w odległości 300 bp. Od miejsca EcoRI znajduje się pojedyncze miejsce HindIII. HindIII trawi również wstawkę na fragmenty 3 kb i 1.5 kb. Narysuj mapę restrykcyjną z rekombinowanego plazmidu zaznaczając długość poszczególnych fragmentów jeśli po trawieniu EcoRI uzyskano fragmenty o długości 4.5 kb i 2.5 kb a po trawieniu HindIII fragment o długości 3.3 kb i 3.7 kb jaka jest orientacja wstawki w plazmidzie względem miejsca HindIII?

[stojekl]

Rysunek


Z informacji w zadaniu możesz zorientować się, że po trawieniu rekombinowanego plazmidu EcoR1 otrzymano liniowy fragment DNA odpowiadający pierwotnemu plazmidowi i fragment odpowiadający wstawce - czyli mamy teraz dwa miejsca EcoR1! Po umieszczeniu na fragmencie plazmidu (niebieski) miejsca HInd3 w odległości 300pz od dowolnego EcoR1 pozostaje się zastanowić gdzie umieścić drugi HInd3 (na wstawce - pomarańczowy) aby po trawieniu tym enzymem otrzymać dwa fragmenty o danych długościach (w tym wypadku koniec 3kb do 300pz i koniec 1.5kb do 2.2pz). Gdybym umieścił go odwrotnie (3kb do 2.2 i 1.5kb do 300pz) otrzymałbym po trawieniu HInd3 fragmenty o dlugościach 5.2kb i 1.8kb.